Табл 1 во Получение EST


Два  принципиальных  подхода к получению EST. 
________________________________________________________________
             кДНК             |     гякДНК                   
  |
 _____________________________|_________________________________|
ПРЕИМУЩЕСТВА                                                    | 
_______________________________________________________________ |
экспрессирующиеся (транскри-  |    экспрессирующиеся (транскри- |
бируемые и транслируемые)     |    бируемые) последовательности |
последовательности генома     |            генома               |
______________________________|_________________________________|
последовательность совпадает  | последовательность совпадает с  |
с мРНК, облегчая              | последовательностью геномной ДНК| 
 дентификацию                 | облегчая анализ с помощью PCR   | 
 генов                        |                                 |          
                                                       |
                              | содержит вариабельные участки,  |
                              | отличающие гены одного семейства| 
______________________________|_________________________________|
НЕДОСТАТКИ                                                      | 
_______________________________________________________________ | 
последовательность кДНК не    | тканеспецефичность экспрессии   | 
совпадает с последователь-    |                                 | 
ностью геномной ДНК           |                                 | 
______________________________|_________________________________| 
тканеспецифичность экспрес-   | сложность  идентификации коди-  | 
сии и низкое (<30%)           | рующих последовательностей      | 
разнообразие  в  любом  типе  |                                 | 
клеток                        |                                 | 
______________________________|_________________________________| 
относительно высокая консер-  |                                 | 
вативность, что приводит к    |                                 | 
сложности дифференциации      |                                 | 
различных представителей      |                                 | 
одного семейства генов или    |                                 | 
генов и псевдогенов           |                                 |
                                       

Смотрите также:

  • EST: Методы получения