Рис 3. Гомология последовательностей надсемейства АВС-ATPаз


Консервативность последовательностей и функция основных остатков у представителей надсемейства АВС-ATPаз.

Ортологи Rad50 (pf - P. furiosis; h - human; sc - S. cerevisiae; ecSbcC - E. coli SbcC) были выровнены по последовательности с белками SMC человека, ассоциированными с хромосомами белками E человека (hCAP-E) и нуклеотидсвязывающими доменами CFTR человека (CFTR-NBD1 CFTR-NBD2) с помощью программы ClustalW (http://www2.ebi.ac.uk/clustalw/) и отредактированы вручную. Обозначены основные консервативные петли. Мутационные участки ScRad50S выделены красным. Треугольники указывают на остатки, вовлеченные в специфическое связывание аденина (красным), фосфата (желтым) и магния (зеленым). Заключенные в прямоугольники остатки представляют собою участок, атакуемый молекулой воды. Альфа- спирали A , проходящие через H, обозначены прямоугольниками, а бета-тяжи с 1-го по 14-й обозначены стрелками (коричневым - Сегмента N, зеленым - Сегмента C).

Смотрите также:

  • Rad50cd: активный центр и функция мотива узнавания
  • Rad50cd: участки взаимодействия с ДНК
  • Консервативные и функциональные мотивы Rad50 и NBD CTFR
  • Белки SMC и конденсация хромосом