Альфоидная ДНК: 4-хромосомоспецифичное семейство D4Z1


Данное семейство представлено PstI-фрагментами клон pYAM 3-84 (1197 н. п.), клон pYAM 7-62 (685 н. п.), клон pYAM 11-97 (686 н. п.) [ Yurov et al., 1987a ; Mashkova et al., 1994 ] и XbaI-фрагментами клон pGXbaII/340 (340 н. п.) [ Hulsebos et al., 1988 ], клон p4n1/4 (675 н. п.) [ D'Aiuto et al., 1993 ], клон pSX1 (341 н. п.) [ Thompson et al., 1989 ].

ПЕВП состоит из 20 мономеров и вырезается рестрикционной эндо-нуклеазой MspI в двух вариантах - как один фрагмент длиной 3,2 т. н. п. или комбинация из двух фрагментов длиной 2,6 т. н. п. и 600 н. п. Из известных нуклеотидных последовательностей реконструирован фрагмент ПЕВП длиной 2123 н. п. (66% длины ПЕВП). Последовательность клона pYAM 3-84 содержит нарушение типичного для второго семейства чередования мономеров D1- D2: третий и четвертый мономеры относятся к типу D1. Mashkova et al. (1994) предложили модель утраты мономера, основанную на механизме неравного кроссинговера. Известные клонированные фрагменты данного семейства при гибридизации in situ в условиях средней жесткости более или менее интенсивно гибридизуются с перицентромерным районом хромосомы 9, что свидетельствует о филогенетической близости этих хромосомоспецифичных семейств.

Смотрите также:

  • АЛЬФОИДНАЯ ДНК: ХРОМОСОМСПЕЦИФИЧЕСКИЕ СЕМЕЙСТВА: СПИСОК
  • АЛЬФОИДНАЯ ДНК: НАДХРОМОСОМНОЕ СЕМЕЙСТВО 2