Альфоидная ДНК: надхромосомные семейства: общие сведения
Первые три надхромосомные семейства были идентифицированы в работах группы Ю.Б. Юрова по изучению гибридизации альфоидных зондов с хромосомами человека в условиях различной жесткости, а также периодичности рестриктных сайтов [ Александров и др., 1986b ; Alexandrov et al., 1988 ; Yurov et al., 1987a ].
Позже путем анализа нуклеотидных последовательностей альфа- сателлитных повторов были идентифицированы и охарактеризованы надхромосомные семейства 4 и 5 [ Alexandrov et al., 1993b ; Romanova et al., 1996 ].
Таким образом, к настоящему времени охарактеризовано 5 надхромосомных семейств, охватывающих, по-видимому, все известные альфа- сателлиты человека и различающихся по структуре предковых повторов и характеру чередования альфоидных мономеров в них [ Alexandrov et al., 1988 ; Romanova et al., 1996 ].
Каждое надхромосомное семейство характеризуется также свойственными только ему типами мономеров . Гомология между консенсусной последовательностью какого-либо типа мономеров и последовательностями индивидуальных мономеров, принадлежащих к этому типу, составляет обычно около 80-90 %.
1 и 2 семейства имеют димерный предковый повтор (типы мономеров этих семейств обозначают как J1-J2 и D1-D2 соответственно [ Alexandrov et al., 1991 ]), 3 семейство характеризуется пентамерной структурой (типы мономеров W1, W2, W3, W4, W5 [ Willard, Waye, 1987a ], обозначения даны по [Alexandrov et al., 1991]), семейство 4 характеризуется мономерной организацией (тип М1), семейство 5 имеет два типа мономеров (R1 и R2), чередующихся неравномерно [ Romanova et al., 1996 ] ( рис 2 каз ).
Последовательности каждого надхромосомного семейства расположены на нескольких хромосомах. Первое надхромосомное семейство локализуется на хромосомах 1, 3, 5, 6, 7, 10, 12, 16 и 19; второе - на хромосомах 2, 4, 8, 9, 13, 14, 15, 18, 20, 21, 22; третье - на хромосомах 1, 11, 17 и Х [ Александров и др., 1986b ; Willard, Waye, 1987a ; Yurov et al., 1987a ; Alexandrov et al., 1988 ].
Первые три надхромосомных семейства охватывают все хромосомы человека, кроме Y и, за исключением хромосом 1 и 18, встречаются только один раз на каждой хромосоме. Локализация надхромосомных семейств 4 и 5 изучена недостаточно.
Принадлежность к тому или иному надхромосомному семейству определяется либо по данным самих авторов, либо путем сравнения опубликованной первичной структуры клонированных последовательностей с двенадцатью консенсусными последовательностями мономеров пяти надхромосомных семейств [ Romanova et al., 1996 ].
Смотрите также:
