Классификация последовательностей с помощью байесовского подхода


Имея на руках секвенированную последовательность, исследователь хочет получить из нее максимальную информацию. Например, он хочет иметь структурно- функциональную разметку последовательности. Таким образом, мы приходим к задаче классификации сайтов и областей на последовательности. Сравнивая выборки фрагментов последовательностей, причем каждый набор отвечает определенной функции, исследователь находит в них статистические закономерности, которые, во-первых, свойственны индивидуальной выборке и, во-вторых, отличают эту выборку от всех остальных. Далее исследователь приходит к представлению об одном элементе выборки, как о наблюдаемой реализации некоторого стохастического процесса, описываемого соответствующей моделью, которая относится ко всей выборке. Получив такое представление, исследователь может заняться классификацией вновь получаемых фрагментов с помощью хорошо известного байесовского подхода ( Ллойд и Ледерман, 1990 ; Liu, 2001 ).

Смотрите также:

  • КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ