ДНК полимераза дельта: структура
ДНК-полимераза дельта представляет собой гетеродимер, состоящий из каталитической субъединицы с мол. массой 125-130 кДа и субъединицы 48-55 кДа, необходимой для связи с фактором процессивности PCNA [ Hashimoto K. et al., 1998 ]. Малая субъединица нужна для преодоления ферментом структурных барьеров в природных однонитевых матрицах [ Eissenberg J.C. et al., 1997 ].
У дрожжей S. pombe ДНК-полимераза дельта состоит из пяти субъединиц: 125, 55, 54, 42 и 22 кДа [ Zuo S. et al., 1997 ].
Обе ферментативные активности - ДНК-полимеразная и 3'-5'- экзонуклеазная - связаны с высокомолекулярным полипептидом. Делеции в N- концевой области не влияют на полимеразную активность, тогда как делеции в центральной и в С-концевой области инактивируют фермент полностью [ Wu S.M. et al., 1998 ].
Взаимодействие каталитической субъединицы 125 кДа с субъединицей 50 кДа подтверждено с помощью двухгибридной системы дрожжей [ Hindges R., Hubscher U., 1997 ].
В действительности нативный фермент может представлять собой тетрамер, содержащий по две субъединицы с мол. массами 125 и 55 кДа, а субъединица 55 кДа является фактором димеризации репликативных холоферментов, подобно субъединице тау в ДНК-полимеразе III E. coli [ Kim S. et al., 1996 ].
Первичная структура ДНК-полимеразы дельта эволюционно консервативна. Первичная структура малой субъединицы ДНК-полимеразы дельта млекопитающих гомологична на 96%, а у ферментов дрожжей и млекопитающих на 57% [ Hindges R., Hubscher U., 1997 , Hindges R., Hubscher U., 1997 ].
Смотрите также: