ВЫБОРКА ИЗОГНУТЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДНК
Известно много примеров встречаемости искривленных фрагментов ДНК среди природных последовательностей (обзор Lilley, 1986 ). Особенно много экспериментальных данных для прокариот ( Travers, 1989 ). Для выяснения картины их распределения на хромосоме E.coli и функциональной роли более подробно были созданы банки плазмид ( Mizuno,1987 ; Tanako et al, 1991 ), содержащие случайно клонированные фрагменты, включающие искривленные структуры ДНК (по аномальной подвижности в геле). Как правило при анализе в основном обращают внимания на A/T тракты. Чтобы иметь представление об особенностях распределения таких трактов, их взаиморасположении приведем примеры ( Рис 21 ). Показательно, что 11 из 12 последовательностей, приведенных в статье Танако и др. ( Tanako et al, 1991 ), происходят из областей, непосредственно предшествующих кодирующим последовательностям, некоторые включают промоторную последовательность, другие локализованы выше "-35 нп" области. Гистоноподобный белок из E.coli, H-NS, имеет сильное сродство к этим искривленным последовательностям.
Смотрите также:
