ДНК: исследование структуры в волокнах (A-тракты ДНК)


Первоначально при изучении дифракции Х-лучей на волокнах полиdA-полиdT в форме натриевой соли возникло представление о том, что полиdА нить находится в А конформации (конформация сахара С3'-эндо), а поли dТ нить в В форме (конформация сахара С2'-эндо), так что общая конформация двутяжевой структуры было названа гетерономной формой ( Arnott,et al,1983 ). В дальнейшем выяснилось, что структура ДНК полиdA-полиdT в волокнах диморфна и ее аллеломорфность может зависеть от влажности волокон ( Park et al, 1987 ). В частности, расчеты кальциевой формы поликристаллических волокон этой же ДНК позволили установить конформацию ДНК как В форму с определенными отличиями между пуриновой и пиримидиновой нитями. Двугранный угол пропеллера АТ пары оценивается в 20 градусов, угол наклона усредненной плоскости пары к плоскости, перпендикулярной оси спирали - 6 градусов, ширина малой бороздки - 9А, конформация фуранозного кольца обеих нитей - С2'эндо ( Alexeev et al, 1987a , Alexeev et al, 1987b ).

Смотрите также:

  • ДНК В КОНДЕНСИРОВАННОМ СОСТОЯНИИ: МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ СТРУКТУРЫ A-ТРАКТОВ