Соотношение Уайта
Соотношение Уайта - это соотношение, которое выражает порядок зацепления краев полосы, Lk , через кручение полосы вокруг оси, Tw , и характеристику, связанную с формой оси полосы, Wr , называемую райзингом . Этот результат можно записать в виде соотношения
Lk = Tw + Wr (1). Основной результат теории полос, выраженный в соотношении (1), означает, что существуют два различных способа структурной реализации сверхвитков в кольцевой ДНК. Первый состоит в изменении осевой закрутки двойной спирали, а второй - в деформации оси спирали и создании тем самым определенного райзинга. Теоретические и экспериментальные исследования позволили ответить на вопрос об относительной доле райзинга и кручения в структурной реализации сверхвитков. Отношение среднего райзинга, <Wr>, к числу сверхвитков в ДНК, <D>, в зависимости от плотности сверхвитков представлено на рис. 16. Как видно из рисунка, для молекул ДНК, длина которых превышает 10 статистических сегментов или 3000 пар оснований, дисперсия райзинга вдвое превышает дисперсию осевой закрутки. Следовательно, для таких молекул 2/3 величины D Lk должно быть реализовано в виде райзинга, и 1/3 в виде изменения осевой закрутки. С уменьшением длины ДНК до 1000 пар оснований и менее вклад изменения осевой закрутки в структурную реализацию сверхвитков постепенно возрастает и для молекул из 200 пар оснований практически равен 1. Кроме того, результаты расчетов зависят от эффективного диаметра двойной спирали. При уменьшении ионной силы и, соответственно, увеличении эффективного диаметра, доля райзинга уменьшается, а средний диаметр сверхспирали увеличивается.
Смотрите также:
