RdRP (РНК-зависимая РНК полимераза)


Клеточный фермент RdRP был найден раньше у растений ( Schiebel et al., 1993a ; Schiebel et al., 1993b ). Было показано, что гены, имеющие гомологию с РНК-зависимой РНК-полимеразой томатов, участвуют в PTGS у растений, quelling у Neurospora и РНК-интерференции в герминальной ткани C. elegans ( Cogoni and Macino, 1999a ; Dalmay et al., 2000b ; Mourrain et al., 2000 ; Smardon et al., 2000 ).

RdRP - РНК-направляемая (РНК-зависимая) РНК-полимераза. Этот фермент, обнаруженный у растений и у С. elegans ( Dalmay et al., 2000 ; Sijen et al., 2001 ), использует siRNAs в качестве праймеров для генерации большого количества dsRNA, которые затем могут процессироваться Dicer в дополнительные siRNA. Таким образом, считается, что первичная функция RdRP - амплификация RNAi -ответа, но RdRP может играть и более специфическую роль в инициации синтеза dsRNA (см. " Синтез dsRNA и образование siRNA "). Действительно, она, по-видимому, участвует в процессе, приспособленном для формирования лучшей защитной реакции хозяина в ответ на введение экзогенной dsRNA. Эта идея подкрепляется тем фактом, что RdRPs не являются участниками путей сайленсинга с помощью miRNA ( Sijen et al., 2001 ). Интересно, что в геномах насекомых (в том числе Drosophila) и позвоночных (включая млекопитающих) отсутствуют распознаваемые RdRP-подобные последовательности, но остается возможность, что у этих организмов синтез dsRNA выполняют другие полимеразы.

Смотрите также:

  • RNAi и сайленсинг генов, направляемый РНК
  • RNAi-путь
  • PTGS: модели ДНК-ДНК-взаимодействия
  • PTGS и сигнал сайленсинга: влияние экспрессии HC-Pro и p25
  • PTGS и TGS: контроль экспрессии клеточных генов
  • siRNA: гипотезы образования и активации
  • RNAi и сборка гетерохроматина у S. pombe
  • РНК-интерференция: активность RdRP у C. elegans