Футпринтинг


Футпринтинг (footprinting) [англ. footprint — след, отпечаток ноги] — метод идентификации участков ДНК, специфически связывающихся с определенными белками. В основе Ф. лежит защита фосфодиэфирных связей ДНК в местах ее контакта с белком от эндонуклеазного расщепления: исчезновение соответствующего рестрикционного фрагмента ДНК на электрофореграмме позволяет локализовать места контакта белка с ДНК. Для Ф. используются различные эндонуклеазы: ДНКазу I, нуклеазу S1 и др. Существуют варианты Ф. с использованием физических факторов (УФ) и химических реагентов (диметилсульфоксид, KMnO4, Fe-EDTA), осуществляющих специфическую модификацию нуклеотидов. Метод Ф. разработан Д. Галасом и А. Шмитцем в 1978 г. См. также Филогенетический футпринтинг.

Смотрите также:

  • Словарь терминов по биотехнологии В.З. Тарантула: алфавитный указатель
  • Что защищает островки CpG от метилирования ДНК?
  • Фотофутпринтинг (photofootprinting)
  • ДНКаза-футпринтинг (DNase footprinting)