Табл. 8.1(epig). Консерватизм RNAi и белков гетерохроматина
Модели распознавания РНК-РНК versus РНК-ДНК
Таблица 8.1. Консерватизм RNAi и белков гетерохроматина [перевод]
|
S. pombe |
A. thaliana |
С. elegans |
Drosophila |
H. sapiens |
Deri |
DCL1 - 4 |
Dcr-1 |
Deri и 2 |
DCR-1 |
Agol |
AGOl-lO |
Rde-1, Alg-1 и -2 |
Agol - 3, Piwi |
AGO-1 - ACO-4 |
|
PRC-1 и 2, и 19 других |
Aubergine/Sting |
Piwi-l-Piwi-4 |
PIW1-1-PIWI-4 |
Chpl3 |
СМТЗ |
- |
- |
- |
Tas3[1] |
- |
- |
- |
- |
Rdpl |
RDR1 - 6 |
Ego-1, Rrf-1 - 3 |
- |
- |
Hrrl |
SGS2/SDE3 |
ZK1067.2 |
GH20028p |
KIAA1404 |
Cidl2 |
В |
Rde-3, Trf-4B |
CG11265 |
POLSB |
Swi6 |
LHP1 (TFL2) |
Hpl-1, Hpl-2, F32E10.6 |
HP1 |
HP1 a, (3, у |
Clr4 |
SUVH2-6 |
Г |
Su(var)3-9 |
SUV39H1 и 2 |
Rikl* |
DDB1 |
M18.5 |
Ddbl |
DDB1 |
Cul4 |
CUL4 |
Cul4 |
Cul4 |
CUL4 |
Sir2 |
SIR2 |
Sir2-1 |
Sir2 |
SIRT1 |
Eril |
ERI1 |
Eri-1 |
CG6393 |
THEX1 |
а Очевидный ортолог хромодоменного белка, Chpl, не был идентифицирован у других модельных организмов, перечисленных здесь, но большинство эукариотических клеток содержит множественные хромодоменные белки. СЬЕЗ у Arabidopsis является хромодоменной ДНК-метилтрансферазой, которая работает в том же пути, что иAG04, и может быть аналогичной Chp 1. 6 Никакие очевидные ортологи Tas3 не были идентифицированы, но имеет место слабое сходство по аминокислотной последовательности с белком, специфичным для яичника и семенника мыши (NP 035152). "Cidl2 относится к большому семейству консервативных белков, имеющих сходство по аминокислотной последовательности с классической поли(А)полимеразой, а также с 2'-5'-олигоаденилатными энзимами. г С. elegans обладает примерно 20 доменными белками SET, но НЗК9 НКМТ не была еще идентифицирована у этого организма. д S. pombe содержит другой Rikl-подобный белок, Ddbl, который участвует в репарации повреждений ДНК, но неизвестно, участвует ли он и в формировании гетерохроматина. |
Смотрите также: