Notice: Undefined variable: title in /mnt/sda4/home/www/cgi-bin/htmext.php on line 121
Untitled document

Untitled document


 Модели распознавания РНК-РНК versus РНК-ДНК

Таблица 8.1. Консерватизм RNAi и белков гетерохроматина [перевод]

S. pombe

A. thaliana

С. elegans

Drosophila

H. sapiens

Deri

DCL1 - 4

Dcr-1

Deri и 2

DCR-1

Agol

AGOl-lO

Rde-1, Alg-1 и -2

Agol - 3, Piwi

AGO-1 - ACO-4

 

PRC-1 и 2, и 19 других

Aubergine/Sting

Piwi-l-Piwi-4

PIW1-1-PIWI-4

Chpl3

СМТЗ

 -

 -

 -

Tas3[1]

 -

 -

 -

 -

Rdpl

RDR1 - 6

Ego-1, Rrf-1 - 3

 -

 -

Hrrl

SGS2/SDE3

ZK1067.2

GH20028p

KIAA1404

Cidl2

В

Rde-3, Trf-4B

CG11265

POLSB

Swi6

LHP1 (TFL2)

Hpl-1, Hpl-2, F32E10.6

HP1

HP1 a, (3, у

Clr4

SUVH2-6

Г

Su(var)3-9

SUV39H1 и 2

Rikl*

DDB1

M18.5

Ddbl

DDB1

Cul4

CUL4

Cul4

Cul4

CUL4

Sir2

SIR2

Sir2-1

Sir2

SIRT1

Eril

ERI1

Eri-1

CG6393

THEX1

 

 

S. pombe

A. thaliana

С. elegans

Drosophila

H. sapiens

Deri

DCL1 - 4

Dcr-1

Deri и 2

DCR-1

Agol

AGOl-lO

Rde-1, Alg-1 и -2

Agol - 3, Piwi

AGO-1 - ACO-4

 

PRC-1 и 2, и 19 других

Aubergine/Sting

Piwi-l-Piwi-4

PIW1-1-PIWI-4

Chpl3

СМТЗ

 -

 -

 -

Tas3[1]

 -

 -

 -

 -

Rdpl

RDR1 - 6

Ego-1, Rrf-1 - 3

 -

 -

Hrrl

SGS2/SDE3

ZK1067.2

GH20028p

KIAA1404

Cidl2

В

Rde-3, Trf-4B

CG11265

POLSB

Swi6

LHP1 (TFL2)

Hpl-1, Hpl-2, F32E10.6

HP1

HP1 a, (3, у

Clr4

SUVH2-6

Г

Su(var)3-9

SUV39H1 и 2

Rikl*

DDB1

M18.5

Ddbl

DDB1

Cul4

CUL4

Cul4

Cul4

CUL4

Sir2

SIR2

Sir2-1

Sir2

SIRT1

Eril

ERI1

Eri-1

CG6393

THEX1

а Очевидный ортолог хромодоменного белка, Chpl, не был идентифицирован у других модельных организмов, перечисленных здесь, но большинство эукариотических клеток содержит множественные хромодоменные белки. СЬЕЗ у Arabidopsis является хромодоменной ДНК-метилтрансферазой, которая работает в том же пути, что иAG04, и может быть аналогичной Chp 1. 6 Никакие очевидные ортологи Tas3 не были идентифицированы, но имеет место слабое сходство по аминокислотной последова­тельности с белком, специфичным для яичника и семенника мыши (NP 035152).

"Cidl2 относится к большому семейству консервативных белков, имеющих сходство по аминокислотной последовательности с классической поли(А)полимеразой, а также с 2'-5'-олигоаденилатными энзимами.

г С. elegans обладает примерно 20 доменными белками SET, но НЗК9 НКМТ не была еще идентифицирована у этого организма. д S. pombe содержит другой Rikl-подобный белок, Ddbl, который участвует в репарации повреждений ДНК, но неизвестно, уча­ствует ли он и в формировании гетерохроматина.

 

Смотрите также:

  • Синтез dsRNA и образование siRNA