Терминация транскрипции у бактерий

Типичные терминаторы , не требующие для своего распознавания РНК-полимеразой E.coli дополнительных белковых факторов, содержат GC-богатый участок, обладающий центральной симметрией, вслед за которым располагается последовательность нуклеотидов, состоящая из выстроенных подряд четырех-восьми остатков A, в матричной цепи ДНК. Транскрипция завершается на конце этой олиго(A)- последовательности или же на следующем за ней нуклеотиде. Предполагается, что после прохождения РНК-полимеразой GC-богатого участка ДНК с центральной симметрией в этом месте РНК образуется шпилька, что приводит к разрушению ДНК-РНК-гибрида в транскрибирующем комплексе .

Оставшаяся часть ДНК-РНК-гибрида нестабильна и легко плавится, поскольку образована 3'-концевой олиго(U)- последовательностью РНК и олиго(dA)-последовательностью терминатора. Первым из комплекса освобождается РНК-продукт, а затем минимальный фермент РНК-полимеразы. После объединения со свободным сигма-фактором образовавшийся холофермент РНК-полимеразы вступает в новый цикл транскрипции. Эффективность терминации транскрипции на таком терминаторе зависит от стабильности терминаторной шпильки РНК: мутации, нарушающие комплементарное спаривание оснований в шпильке, ослабляют терминацию, а мутации, восстанавливающие комплементарность, ее усиливают.