Факторы транскрипции: класс 4.6 (HMG-факторы)
Белки этого класса обладают гомологией с хромосомными белками, принадлежащими к группе негистоновых белков с высокой электрофоретической подвижностью (HMG) . Участок гомологии содержит ДНК-связывающий домен, который в одних случаях, как и у HMG1 , обеспечивает белкам неспецифическое взаимодействие с ДНК, а в других (например, у фактора LEF-1 ) - сайт-специфическое. Домен обнаруживает типичную конформацию в форме буквы L с тремя альфа-спиралями. Третья спираль вместе с N- концевой частью спирали 1 далеко выдвинуты и образуют длинную часть L-образного домена, а C-концевая часть спирали 1 и спираль 2 - короткую. Взаимодействие с малой бороздкой ДНК вызывает резкий (более чем на 90*) ее изгиб в сторону от белка. Общая топология комплекса напоминает таковую комплекса TBP-TATA-бокс.
В классе шесть семейств: 1) SOX ( SRY , Sox ; всего 15 факторов); 2) TCF-1 (всего 12 факторов); 3) HMG2-подобные факторы ( SSRP1 , Ixr1 ; всего четыре фактора); 4) UBF (три фактора); 5) MATA (один фактор: mat-Mc ); 6) прочие факторы, содержащие HMG- бокс (всего три фактора).
Общее число факторов - 38.
Смотрите также:
