Гомеодомены: взаимодействие с ДНК
Будучи впервые идентифицированным в некоторых генах дрозофилы, регулирующих развитие, гомеодомен представляет собой консервативную последовательность из 60 аминокислотных остатков. Гомеодомен-содержащие белки обнаружены теперь у всех изученных эукариот, от дрожжей до человека.
Третичная структура гомеодомена, как было впервые показано исследованиями с помощью ЯМР в растворе гомео- доменов Antennapedia дрозофилы, состоит из трех альфа-спиралей (1, 2, 3) и подвижного N-концевого плеча. Вторая и третья спирали этого компактного трехспирального домена обладают структурным сходством с мотивом " спираль-поворот спираль " репрессоров прокариот . Исследования показали, что гомеодомен взаимодействует преимущественно в области обеих бороздок, причем спираль N 3 контактирует в области большой бороздки ДНК, а N-концевое плечо - в области смежной с ней малой бороздки ( Рисунок 3 ). Помимо этого, рентгено-структурный анализ комплекса ДНК с белком engrailed выявил множество контактов боковых цепей с сахарофосфатным остовом.
См. Гомеодоменные белки: петли в ДНК
Смотрите также:
