Основные критерии включения молекул в суперсемейство Ig
Основными критериями включения белков в суперсемейство являются доменная организация молекул и статистически достоверная гомология с известными иммуноглобулинами.
Каждый домен , входящий в состав иммуноглобулина, представляет собой двухслойное молекулярное образование, построенное по принципу нескольких антипараллельных бета-структур, стабилизированных -S-S- связями.
V-домен иммуноглобулина имеет четыре бета-структуры в каждом слое и один дополнительный бета-сегмент, соединяющий два молекулярных слоя. 65-75 аминокислотных остатков домена данного типа составляют участок полипептидной цепи, ограниченной цистеиновым мостиком.
У С-домена иммуноглобулина имеется четыре бета-структуры в одном слое и только три - в другом. Число аминокислотных остатков, ограниченных цистеиновой связью, равно 55-60.
Необходимыми условиями включения анализируемого домена в состав суперсемейства являются гомологичность его аминокислотной последовательности иммуноглобулинам и сходство его пространственной организации с V- или C-доменами иммуноглобулинов. К настоящему времени все изученные домены суперсемейства по степени гомологии различным доменам иммуноглобулинов делятся на три группы: V-группа доменов , С1-группа доменов и С2-группа доменов .
Смотрите также:
