Картирование всех метилированных цитозинов в известной ДНК


Метод [ Clark, ea 1994 ] основан на превращении всех неметилированных остатков цитозина в урацил в результате обработки ДНК бисульфитом натрия (после обработки нити ДНК оказываются в участках модификации некомплементарными друг другу). Амплификация исследуемой последовательности с помощью ПЦР и последующее секвенирование выявляют как цитозин только те цитозиновые остатки, которые в исходной нити были метилированы. Чувствительность метода соответствует чувствительности ПЦР. Этот метод позволил исследовать статус метилирования отдельных генов в раннем эмбриональном развитии (на стадии двух клеток), а также выявить те динуклеотиды CpG в составе CpG-островков, метилирование которых необходимо и достаточно для подавления транскрипции соответствующего гена [ Walsh, ea 1999 , Warnecke. ea 1998 , Cote. ea 1998 ].

Смотрите также:

  • МЕТИЛИРОВАНИЕ ДНК: МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ