Микоплазмы: RBS
мРНК большинства генов микоплазм содержит сайт связывания рибосомы (RBS), который, так же как и последовательность Шайн-Дальгарно грамположительных бактерий, гомологичен 3'-концу 16S рРНК ( Shine, Dalgamo, 1974 ).
Эта последовательность расположена на расстоянии 4-10 нуклеотидов перед инициаторным кодоном и образует водородные связи с 3'-концом 16S рРНК рибосомы.
Соответствующая область 16S рРНК, с которой образует связь большинство RBS микоплазм содержит последовательность S'- AUCACCUCCUUUCU-S'' Таким образом, в состав типичного RBS микоплазмы должна входить часть (не менее 5 оснований) последовательности 5'-AGAAAGGAGGTGAT-3'.
Нуклеотидная последовательность гена 16S рРНК была определена у многих микоплазм, что позволило предложить на ее основе филогению этих организмов ( Weisburg et al. 1989 ). У большинства микоплазм молекула 16S рРНК имеет на 3'-конце дополнительные 4 нуклеотида по сравнению с типичной молекулой 16S рРНК грамположительных бактерий и 7 нуклеотидов по сравнению с грамотрицательными бактериями ( Bove, 1993 ). Эти дополнительные нуклеотиды могут быть использованы при образовании связи с мРНК, приводящей к образованию более сильной связи в получаемом таким образом комплексе рибосома-мРНК.
Новый RBS был обнаружен в гене tuf M. genitalium ( Loechel et al., 1991 ). Последовательность SD в этом гене отсутствует, тем не менее ген хорошо экспрессируется. Предполагается, что составляющая этот RBS последовательность S'-UUAACAA-CAU-3' образует дуплекс с высококонсервативной областью молекулы 16S рРНК, соответствующей 1082-1093 нуклеотидам 16S рРНК Е. coli. Ген tuf M. genitalium является единственным известным примером гена с альтернативным RBS, однако нельзя исключить возможность обнаружения у микоплазм и других генов с необычными RBS.
Смотрите также:
