Микоплазмы: содержание G+С
За малым числом исключений, содержание G+С в микоплазменных геномах находится в пределах 24-33 мол%. Межгенные области являются более АТ-богатыми, чем кодирующие области. Смещение нуклеотидного состава генома микоплазм проявляется в преимущественном использовании АТ-богатых кодонов. Такие же низкие значения G+С известны и для некоторых клостридиевых ( Russel et al., 1973 ), что рассматривается как дополнительный аргумент в пользу предположения о происхождении микоплазм от клостридиальной ветви грамположительных бактерий ( Woese et al., 1980 ; Woese, 1987 ).
Распределение G+С по длине генома у микоплазм неравномерно. При среднем значении содержания G+С в геноме M. pneumoniae 32 мол% содержание G+С для ее рибосомных генов составляет 52 мол%. Гены белков адгезинов M. pneumoniae P1 и открытой рамки считывания номер 6 (ОРС6) содержат G+С по 56 мол%, в то время как область начала репликации содержит лишь 26 мол% G+С при среднем на геном составе 40 мол% G+С. В некоторых межгенных областях M. pneumoniae содержание А+Т достигает 80-90 мол% ( Himmelreich et al., 1996 ).
Среднее содержание G+С в геноме Ureaplasma urealyticum составляет 25.5 мол% и является рекордно низким для бактериальных геномов. Наиболее низким содержанием G+С (до 15 мол%) отличаются присущие только V. иrеаlylitcum гены, не имеющие гомологов в геномах M. genitalium и M. pneumoniae. Из 289 таких генов 80 имеют GС-состав 22-23 мол% ( Glass et al., 2000 ).
Смотрите также:
