Методы современного предка построения деревьев
Сходным методом является подход Клотца метод современного предка - Present day ancestor method, ( Klotz L.C.,Blanken R.L.1981 ). Как и предыдущий метод он дает точное решение для аддитивного дерева. Исходное расстояние между таксонами i и j заменяется на расстояние от некоторого таксона k, выбираемого в качестве предкового, до точки ветвления таксонов i и j. Пересчитанная таким образом матрица расстояний обрабатывается далее стандартным методом UPGMA для получения топологии дерева.
Выбор современного таксона в качестве предкового не ограничен какими-либо предпочтениями, но на наш взгляд в качестве предкового следует выбирать таксон, наиболее удаленный от всех остальных.
Смотрите также:
