Тест для сравнения скоростей эволюции
Отсутствие однозначных датировок времени дивергенции для многих видов порождает сложности при выяснении вопроса о равномерности темпов эволюции в тех или иных филогенетических линиях. Чтобы избежать этого Сэрих и Вильсон ( Sarich and Wilson, 1973 ) предложили тест для сравнения темпов эволюции (relative-rate test).
Допустим мы сравниваем темп в линиях ведущих от общего предка O к видам A и B. Тогда нам нужен еще и вид С в качестве репера. Мы должны быть уверены, что вид С отделился от общего ствола раньше, чем разделились виды A и B.
┌────┴─────┐
│ │
O │ │
┌───┴───┐
│
│ │ │
│ │ │
A B C
Из рисунка видно, что число различий между A и C равняется сумме расстояний от точки A до O и от точки O до C:
K(AC)=K(AO)+K(OC) Аналогично
K(BC)=K(BO)+K(OC)
K(AB)=K(AO)+K(BO) Мы можем прямо оценить K(AB),K(AC) и K(BC), следовательно можем вычислить и K(AО),K(BO) и K(CO):
K(AO)=(K(AC)+K(AB)-K(BC))/2
K(BO)=(K(BC)+K(AB)-K(AC))/2
K(CO)=(K(AC)+K(BC)-K(AB))/2
Теперь мы можем сравнить K(AO) и K(BO), что и являлось нашей целью. Следует отметить, что более грубое сравнение можно произвести сразу сравнивая значения K(AС) и K(BС). Часто в качестве критерия используется разница K(AО)-K(BО) или K(AC)-K(BC), чем она ближе к 0, тем более близки темпы эволюции в соответствующих линиях.
Смотрите также:
