Мутация: анализ кластеризации мутаций


В работе ( Gearhart, Bogenhagen, 1983 ) исследовалась кластеризация соматических мутаций в V-генах иммуноглобулинов . Для вычисления ожидаемого расстояния между случайно разбросанными мутациями использовался следующий подход. Доля мутаций, находящихся на расстоянии не более s оснований от друг от друга, вычисляется по формуле

           
          s= k-1
                          
#                   p(s) =S f * (1 - f) ,                (1.1)
                          -
                         k=1
k=1 где f - средняя частота мутаций в пересчете на один нуклеотид
(вычисленная для определенного гена). 
С помощью этой формулы для
4-х V-генов показано, что соматические мутации в них в среднем расположены
на достоверно более 
близких расстояниях, чем случайно
разбросанные по последовательности. На основании выявленной кластеризации
предполагается,
 что эти мутации возникли в результате ошибок
ДНК-полимеразы (Gearhart, Bogenhagen,
1983).

Смотрите также:

  • МЕТОДЫ АНАЛИЗА РОЛИ НУКЛЕОТИДНОГО КОНТЕКСТА В МУТАГЕНЕЗЕ
  • Нуклеотидов замены: анализ