Факторы транскрипции с доменом "цинковый палец" типа Cys4
К классу факторов с цинковым пальцем типа Cys4 прежде всего относятся факторы, которые имеют GATA-подобную структуру , принадлежащие к семейству (2.2.1). Белок GATA-1 был обнаружен как эритроид-специфичный фактор , связывающийся с регуляторными элементами в глобиновых генах [ Evans T. et al., 1988 ]. Впоследствии были обнаружены и клонированы другие родственные факторы позвоночных (2.2.1.1) и грибов ( 2.2.1.2 ). Все они содержат один или два цинковых пальца [ Evans T. et al., 1989 ].
Консенсусная последовательность для первого цинкового пальца имеет вид: CxNCx4TPLWRRx3GxxLCNACgl. Если присутствует второй цинковый палец типа GATA , он имеет замены P --> T в 10-й позиции и L --> V в 21-й позиции консенсуса. Интересно отметить, что до настоящего времени у позвоночных и нематод были обнаружены исключительно двойные цинковые пальцы, тогда как у грибов выделены белки, содержащие только один GATA-палец. Тем не менее, этот мотив оставался удивительным образом неизменным в ходе эволюции.
Структура цинкового пальца типа GATA реконструирована с помощью ЯМР [ Omichinski J.G. et al., 1993 ]. Оказалось, что у факторов, содержащих два цинковых пальца типа GATA, С-концевой мотив обеспечивает специфические контакты с ДНК, в то время как N-концевой осуществляет общую стабилизацию ДНК-белкового комплекса [ Omichinski J.G. et al., 1993 ]. С-концевой цинковый палец обладает топологией, сходной с топологией ДНК-связывающего пальца ядерных рецепторов (у которых он является N-концевым). При этом его альфа-спираль обращена к большой бороздке ДНК. Последовательность, прилегающая к С-концевому пальцу молекулы GATA-1, имеющая вытянутую конформацию, также вовлечена в специфическое связывание с ДНК [ Omichinski J.G. et al., 1993 ].
Смотрите также:
