Анализ сцепления
Анализ сцепления - это метод генетического картирования, основанный на прослеживании косегрегации генов или генетических маркеров при передаче от родителей к потомкам в ряду поколений [ Ott, 1991 ; Terwilliger and Ott, 1994 ]. Анализ сцепления представляет собой проверку наблюдаемой картины сегрегации признаков и генетических маркеров в родословной на соответствие определенной модели наследования. При этом рассчитываются вероятности за и против сцепления в данной семье. Количественным показателем сцепления является логарифм соотношения шансов за и против сцепления - лод-балл. Сцепление считается подтвержденным, если лод-балл превышает определенное значение. В генетике человека для единичного наблюдения принято пороговое значение лод-балла равное 3, что соответствует шансам за сцепление 1000:1 [ Ландер, 1990 ]. Сейчас анализ сцепления проводят, используя, как правило, большое число маркеров (мультилокусный анализ сцепления), распределенных по всему геному. При этом рассчитывается соотношение вероятностей для каждого интервала между двумя соседними маркерами. Интервалы со значением лод-балла, превышающим пороговый, и есть наиболее вероятные области локализации генетического маркера болезни. Мультилокусный анализ сцепления требует обширных вычислений, которые осуществляются специально разработанными программами - LINKAGE, FASTMAP и др. [ Latrop et al, 1984 ; Curtis and Gurling, 1993 ]. Анализ сцепления успешно используется при картировании простых моногенных признаков. Он может применяться и в тех случаях, когда в наследование заболевания вовлечен более чем один ген. Например, данный метод позволил получить обещающие результаты при сцеплении гена шизофрении с локусом 1q21 [ Brzustowicz et al, 2000 ].
См.Генодиагностика с помощью анализа сцепления
Смотрите также:
