РНК редактирование мРНК миксомицетов - гриба Physarum polycephalwn
Редактирование митохондриальных транскриптов миксомицета Physarum polycephalum, впервые описанное в 1991 г., происходит в основном путем инсерций цитидина. Так, в одной молекуле мРНК альфа-АТФазы было обнаружено 54 некодированных цитидина [ Mahendran ea 1991 ]. Всего в митохондриальных РНК Physarum обнаружено около 1000 точек эдитинга, причем они располагаются не только в мРНК, но и в рРНК , и в тРНК . Physarum polycephalum до сих пор остается единственным из изученных организмов, в котором встречаются оба типа эдитинга - как вставки, так и замены нуклеотидов. Чаще всего встраиваются цитидиновые мононуклеотиды - во множество точно соблюдаемых точек, реже - G- и U-остатки, иногда наблюдаются инсерции определенных динуклеотидов (UA, АА, GU, CU, GC) и замены С на U. В среднем наблюдаются инсерций по 1 на каждые 25 нуклеотидов мРНК и на каждые 40-45 нуклеотидов рРНК. По 1-2 вставки (в основном - цитидин) обнаружены в четырех тРНК [ GottJ.M., ea 1998 ].
Все эти множественные типы эдитинга предполагают наличие нескольких механизмов редактирования [ Simpson ea 1995 ]. С помощью системы изолированных митохондрий Physarum показано, что инсерций мРНК происходят по позициям, находящимся на расстоянии не далее 14-22 нуклеотидов от сайта, который в это время транскрибируется (а возможно, и гораздо ближе) [ Visomirski-Robic ea 1997 ]. Вероятно, что наблюдаемый инсерционный эдитинг может быть физически или функционально связан с транскрипцией .
Конверсии же нуклеотидов C-U, вероятно, осуществляются посттранскрипционно, как это происходит в митохондриях и хлоропластах растений [ GottJ.M., ea 1998 ]. Отсутствие полярности эдитинга и другие особенности этого процесса у Physarum отличают его от редактирования кинетопластной мРНК . Механизмы узнавания сайтов и биохимические процессы эдитинга у Physarum пока неясны [ Visomirski-Robic ea 1997 ]. Не удалось обнаружить сайты эдитинга в плазмидах митохондрий Physarum, что свидетельствует об их ином происхождении [ Takano ea 1997 ].
Смотрите также:
