Докинг (docking)
Докинг (docking) [англ. dock — состыковывать] — 1) компьютерное моделирование с использованием специфических компьютерных средств визуализации in silico, применяемое для построения и анализа тех теоретически возможных путей, с помощью которых определенная молекула вещества (напр., молекула-кандидат для создания нового фармацевтического средства) будет связываться (как лиганд) с определенными молекулами-мишенями (рецепторами, ферментами, генами и др.). Д. использует в качестве стартовой информации трехмерную структуру белка (на данном этапе развития технологии, как правило, конформационно неподвижную) и структуру лиганда (см. Лиганд); в процессе Д. может моделироваться конформационная подвижность лиганда. Результатом Д. является конформация лиганда, наилучшим образом взаимодействующая с белковым сайтом связывания; 2) Д.-белок — белок-рецептор сигналузнающей частицы, участвующий в экзоцитозе белков (см. Экзоцитоз); 3) неспецифическая адгезия микроорганизмов (см. Адгезия микроорганизмов).
Смотрите также:
