Консенсусная последовательность, каноническая последовательность (consensus sequence, canonical sequence)
Консенсусная последовательность, каноническая последовательность (consensus sequence, canonical sequence) [лат. consensus — согласие, единодушие] — усредненная нуклеотидная или аминокислотная последовательность, регулярно встречающаяся (с небольшими вариациями по отдельным нуклеотидам или аминокислотам) в данном генетическом элементе (напр., в промоторе) у разных генов, в повторяющихся нуклеотидных последовательностях или у разных белков. Создается на основе массива выровненных последовательностей. В каждом положении К.п. находятся нуклеотиды (аминокислоты), наиболее часто встречающиеся в данном положении во всей совокупности родственных последовательностей. К.п. описывает некую идеальную (усредненную) последовательность мономеров. Напр., К.п. Хогнесса (см. Блок Хогнесса), расположенная в промоторных областях разных эукариотических генов, представляет собой Т83А97Т93А85А63А83А50(цифры показывают частоты присутствия каждого из оснований в разных генах в процентах).
Смотрите также:
