Селекция in vitro, эволюция in vitro, систематическая эволюция лигандов при экспоненциальном обогащении (in vitro selection, in vitro evolution, selective evolution of ligands by exponential enrichment, SELEX)
Селекция in vitro, эволюция in vitro, систематическая эволюция лигандов при экспоненциальном обогащении (in vitro selection, in vitro evolution, selective evolution of ligands by exponential enrichment, SELEX) [лат. selectio — выбор, отбор; лат. in vitro — в пробирке] — метод, основанный на использовании комбинаторной библиотеки, состоящей из огромного числа отличающихся по нуклеотидной последовательности дезокси- или рибоолигонуклеотидов (1012—1015 видов молекул), для селекции (см. Селекция) в ней единичных олигонуклеотидов — аптамеров (см. Аптамеры), которые способны специфически взаимодействовать с определенными молекулами лиганда (низкомолекулярные вещества, высокомолекулярные соединения, включая белки и нуклеиновые кислоты, вирусные частицы и даже клетки) с высоким сродством и специфичностью. Отбор аптамеров осуществляется с помощью нескольких раундов, каждый из которых состоит из трех стадий: а) библиотека олигонуклеотидов инкубируется с молекулой-мишенью; б) комплексы олигонуклеотидов с мишенью отделяются от несвязавшихся олигонуклеотидов и в) производится амплификация связавшихся с мишенью олигонуклеотидов. В результате происходит постепенное обогащение библиотеки олигонуклеотидов отдельными олигонуклеотидами, обладающими повышенным сродством к молекуле-мишени. Метод предложен в 1990 г. независимо Г. Джоисом, Дж. Шостаком и Л. Голдом.
Смотрите также:
