Серийный анализ генной экспрессии (serial analysis of gene expression, SAGE)
Серийный анализ генной экспрессии (serial analysis of gene expression, SAGE) [лат. series — ряд; греч. analysis — разложение, расчленение; греч. genos — род, происхождение; лат. expressio — выражение] — молекулярно-генетический метод, позволяющий одновременно количественно и качественно охарактеризовать экспрессию тысяч различных генов путем анализа их транскриптов. Два основных принципа лежат в основе С.а.г.э.: а) короткие нуклеотидные последовательности ДНК («ярлыки») (10—14 п.н.), достаточные для идентификации индивидуальных генных продуктов, и б) конкатемеризация таких ярлыков (связывание их друг с другом в одну последовательность), что многократно увеличивает эффективность идентифицирования экспрессированной мРНК в библиотеках. Теоретически ярлык длиной 14 п.н., состоящий из составляющих любую нуклеотидную последовательность ДНК четырех видов нуклеотидных оснований, может определить 414 разных транскриптов, что многократно превосходит число генов, предположительно содержащихся в геноме человека и млекопитающих. Метод предложен В. Велкулеску в 1999 г.
Смотрите также: