Геном парамиксовирусов


Геномная РНК вирусов семейства Paramyxoviridae представляет собой единую полинуклеотидную нить, содержащую у разных вирусов (15-19)x1000 н.о. Помимо генов (т.е. участков, на которых синтезируются вирусные мРНК) геномная РНК содержит концевые участки, лидерный на З'-конце (около 50 н.о.) и трейлерный на 5'-конце (50-161 н.о.).

У вирусов, входящих в роды Respirovirus и Morbillivirus , гены распределены в составе геномной РНК в следующем порядке от 3'- к 5'- концу: N - Р - М - F - Н (или HN )- L .

У вирусов рода Rubulavirus между генами F и HN находится ген белка SH .

Структура генома вирусов подсемейства Pneumovirinae более сложна и может включать до 10 генов, как у РСВ .

Гены отделены один от другого межгенными участками. У вирусов родов Respirovirus и Morbillivirus каждый межгенный учасок содержит 3 нуклеотида (обычно GAA). У вирусов, входящих в роды Rubulavirus и Avulavirus и подсемейство Pneumovirinae , длина межгенных участков варьирует в широких пределах (1-56 и.о.). В конце нуклеотидной последовательности каждого гена имеется короткий олигоуридиловый участок, являющийся сигналом полиаденилирования и одновременно сигналом терминации синтеза мРНК. В начале каждого гена присутствует консервативный и сходный у всех генов участок, функционирующий как сигнал реинициации транскрипции после ее терминации.

У большинства вирусов семейства Paramyxoviridae ген Р содержит информацию для синтеза нескольких белков, что достигается за счет наличия в мРНК дополнительных рамок считывания, а также за счет вставки дополнительных нуклеотидов при транскрипции.