Рекомбинация ретровирусов
Для рекомбинации ретровирусам необходимо два цикла репродукции. В первом цикле в результате смешанной инфекции образуются вирусные частицы, у которых в диплоидном геноме каждая из двух молекул геномной РНК получена от разных вирусов-родителей. Во втором цикле репродукции обратная транскриптаза при синтезе ДНК может несколько раз перейти с одной геномной РНК-матрицы на другую, образуя рекомбинантную нить ДНК. Сигналом для таких переходов могут служить разрывы в полинуклеотидной нити геномной РНК, а также участки замедления или остановки обратной транскрипции, сигналами для которых являются участки РНК с выраженной вторичной структурой. Возможны и прямые переходы на другую матрицу, не зависящие от разрывов или сигналов приостановки синтеза. Такие переходы могут возникать в результате образования дуплексов между комплементарными участками новосинтезированной ДНК и второй (нетранскрибируемой в данный момент) молекулой геномной РНК. Высокая частота актов перехода транскриптазы с одной РНК-матрицы на другую приводит к мозаичной структуре рекомбинантной ДНК. Поэтому у ретровирусов не наблюдается зависимости между расстоянием между мутациями в геноме и частотой рекомбинации по определенному маркеру, в отличие от полиовируса , у которого вероятность рекомбинационного события низка и, как правило, при одном акте репликации происходит не более одной смены матриц.
Смотрите также:
