Определение последовательности генома вируса лихорадки Западного Нила
Определение полной последовательности генома вируса лихорадки Западного Нила.
На первом этапе работы была собрана полная на момент проведения исследований информация о геномах родственных вирусов и сделано выравнивание их нуклеотидных последовательностей, что позволило предположить наличие консервативных областей в генома и на расстоянии примерно 3500 н.о. от 5'-конца. Были использованы праймеры (несколько вариантов различных пар) для получения фрагмента ПЦР , который явился в дальнейшем стартовой площадкой для определения полной нуклеотидной последовательности генома. При выборе праймеров руководствовались в первую очередь наиболее консервативными участками генома этой группы вирусов. После определения нуклеотидной последовательности фрагмента ПЦР был выбран специфичный праймер, который использовался для ПЦР в паре с высокогомологичным к следующему высококонсервативному участку генома. Затем подобный цикл повторялся необходимое количество раз для определения полной нуклеотидной последовательности генома вируса лихорадки Западного Нила.
Смотрите также:
