Фактор TFIIIA

Фактор TFIIIA из овоцитов шпорцевой лягушки Xenopus laevis ( Miller et al., 1985 ) необходим для правильной инициации транскрипции генов 5S РНК с участием РНК полимеразы III . Оказалось, что для проявления присущих TFIIIA ДНК- и РНК-связывающих активностей абсолютно необходимы атомы цинка . При изучении первичной структуры этого фактора были обнаружены повторяющиеся элементы, состоящие из 30 аминокислот. Опыты по ограниченному протеолизу белка показали, что ДНК-связывающая активность локализована в компактных доменах размером 3 кДа. Консенсус повторяющихся единиц (каждая состоит из 30-ти аминокислот) имеет следующий вид: (Tyr,Phe)-X-Cys-(X2,4)-Cys-(X3)-Phe-(X5)-Leu-(X2)-His-(X3-4)-His-(X2,6)

Подобный мотив относится к Cys-His типу "цинковых пальцев" . ATOM Zn , расположенный между консервативными остатками Cys и His, выполняет роль координатора при сборке домена. Структурные исследования повторяющихся элементов показали, что каждый из них состоит из двух антипаралельных (B-складок и A-спирали, удерживаемых вместе атомом Zn ( Berg, 1990 ) . Узнавание специфической последовательности достигается путем взаимодействия боковых групп аминокислотных остатков, расположенных в N-концевой части а-спирали мотива, с гуаниновыми основаниями в большой бороздке ДНК. Каждый цинковый палец взаимодействует с 3-5 парами нуклеотидов.