Неальфоидные повторы в прицентромерных районах хромосом 13 и 21
В прицентромерном районе хромосом 13 и 21 человека картирован ряд клонированных последовательностей, содержащих сателлитные повторы неальфоидной природы. Одна из таких последовательностей - это клон pTRI6 , содержащий классический сателлит I [ Kalitsis et al., 1993 ]. Этот клон был получен из соматического клеточного гибрида PgMe , содержащего хромосому 13 человека. Методом FISH этот клон был картирован в проксимальной части коротких плеч всех акроцентрических хромосом. При построении физической карты прицентромерных районов хромосом 13, 14 и 21 при помощи электрофореза в пуль- сирующем поле домен, соответствующий этому клону, был выявлен только на хромосоме 21. Он расположен в проксимальной части длинного плеча вблизи локуса D21Z1 и имеет размер менее 50 т. н. п. [ Trowell et al., 1993 ]. В прицентромерном районе хромосомы 13 сателлит I обнаружен не был, хотя авторы ссылаются на собственные неопубликованные данные, свидетельствующие о наличии протяженного домена сателлита I в проксимальной части коротких плеч хромосом 13, 14 и 21, дистальнее домена сателлита III. В прицентромерном районе хромосом 13, 14 и 21 картирован клон pTR9 [ Vissel et al., 1992 ], содержащий, наряду с альфа- сателлитами, последовательность сателлита III длиной 1,5 т. н. п. Соответствующий ему домен сателлита III локализован внутри локуса alpha13-II/21-II ( рис 4 каз ).
Несателлитные последовательности, расположенные в прицентромерном районе хромосом 13 и 21, пока еще мало изучены. Известно, что районы, примыкающие к центромере , неоднократно подвергались различным перестройкам, что привело к формированию в прицентромерных районах этих хромосом протяженных участков, имеющих гомологию с другими хромосомами и являющихся низкокопийными повторами. Один из таких повторов, chAB4 , обнаружен в проксимальном районе коротких плеч хромосом 21 и 22 [ Wohr et al., 1996 ]. Он представляет собой два инвертированных дуплицированных участка длиной около 90 т. н. п., между которыми находится фрагмент длиной около 60 т. н. п. На хромосомах 21 и 22 повтор сhAB4 граничит, с одной стороны, с альфа- сателлитной ДНК, а с другой - с сателлитом III и ?-сателлитами. Этот повтор также обнаружен в прицентромерных районах хромосом 1, 3, 4, 9, 13, 14, 15 и Y.
Другим примером низкокопийного повтора служит локус, содержащий псевдоген нейрофиброматоза ( NF1 ), расположенный в прицентромерном районе хромосомы 21. Он содержит копию фрагмента геномной последовательности активного гена NF1, расположенного на хромосоме 17 [ Cawthon et al., 1990 ]. Локусы, содержащие фрагменты гена NF1, обнаружены на хромосомах 2, 12, 14, 15, 20, 22 [ Cummings et al., 1996 ]. Существование нескольких неактивных копий гена NF1 может объяснить необычно высокий уровень спонтанных мутаций в этом гене. Предполагается, что псевдогены являются "резервуарами" мутаций, способными изменять структуру активного гена при помощи мутаций, расположенных в непосредственной близости от границ сателлитных доменов.
Смотрите также:
