Коагуляционный фактор VII. Строение гена
Gene: [13q34/F7] coagulation factor VII
В 1981 году была идентифицирована аминокислотная последовательность коагуляционного фактора VII (F Vll) (Kisiel W.,1981).
В 1986 году Hagen F.S. ( Hagen F.S.,1986 ) проклонировал кДНК фактора VII (F Vll) человека. Выделенный клон кДНК кодировал зрелый пептид из 406 аминокислот. На основе нуклеотидной последовательности была эмпирически выведена аминокислотная последовательность. На основе основе анализа двух различных клонов кДНК было показано, что фактор VII синтезируется с препролидерной последовательностью из 38 или 60 аминокислот. На основе анализа нуклеотидной и аминокислотной последовательностей было также установлено, что превращение фактора VII (F Vll) в активную форму VIIа ( F Vlla) происходит путем расщепления пептидной связи arg-152/ile-153 факторами FXa или FXll или протромбином с образованием легкой цепи из 152 аминокислот и тяжелой цепи из 254 аминокислот. Легкая цепь содержит Gla домен и два домена EGF (epidermal growth factor), тяжелая цепь содержит каталитический центр сериновой протеазы. Легкая и тяжелая цепи соединены между собой дисульфидной связью, образуемой между cys-135 в легкой цепи и cys-110 в тяжелой цепи. На аминотерминальном конце фактора VII расположен 10 глутаминовых аминокислотных остатков - возможных сайтов карбоксилирования. Данные аминокислоты локализуются в тех же позициях, что и у других витамин К- зависимых протеинов, формируя Gla домен. Gla домен витамин К-зависимых протеинов участвует в связывании кальция и фосфолипидных компонентов тканевых факторов в процессе свертывания крови. За Gla доменом располагаются два EGF домена. Их функция не установлена. Впервые они были выявлены у фактора X (Dayhoff M.O.,1978; Doolittle R.F.,1984 ; Leytus S.P.,1986 ) и присутствуют также у фактора IX ( Anson D.S.,1984 ) протеина С ( Foster D.C.,1985 ) и протеина S (Benton W.D.,1977).
Фактор VII (F Vll) имеет большую степень гомологии по аминокислотной последовательностями с другими витамин К-зависимыми плазменными протеинами - протромбином ( Degen S.J.F.,1983 ), фактором IX ( Anson D.S.,1984 ; Yoshitake S.,1985 ), фактором X ( Leytus S.P.,1986 ), протеинам C ( Foster D.C.,1985 ; Plutzky J.,1986 ), протеином S ( Lundwall A.,1986 ), протеином Z ( Hojru P.,1985 ). Так степень гомологии с протромбином достигает 25% ( Degen S.J.F.,1983 ); фактором IX (F lX) - 40% ( Yoshitake S.,1985 ); фактором X (F X) - 40% ( Leytus S.P.,1984 ); белком С - 40% ( Foster D.C.,1985 ; Beckmann R.J.,1985 ).
В 1987 году O'Hara ( O'Hara P.J.,1987 ) проклонировал ген фактора VII (F Vll) человека и сексенировал полную нуклеотидную последовательность данного гена. Нуклеотидная и аминокислотная последовательности гена фактора VII (F Vll) представлены на рис. F 7 seq ( Рис. F 7 seq ).
Размер гена фактора VII составляет более 12,8 килобаз и состоит из 9 экзонов и 8 интронов. Размер экзонов варьирует от 25 до 1600 нуклеотидов, размер интронов колеблется от 68 до 2574 нуклеотидов. Экзон-интроныые сочленения в гене фактора VII представлены в таблице F 7 int ( Таблица F 7 int ). Позиции интронов по отношению к кодирующим областям аминокислот у гена фактора VII локализуются в тех же сайтах, что и у генов факторов IX и X и протеина C. Данные экзоны кодируют домены, консервативно закрепленные среди членов данного семейства протеинов.
мРНК фактора VII может проходить альтеранативный сплайсинг, образуя один транскрипт из 8 сегментов-экзонов и другой транскрипт с дополнительным экзоном, кодирующим большую препролидерную последовательность. Ген фактора VII содержит копии последовательностей, ассоциированных с регуляцией транскрипции и трансляции.
В гене фактора VII в положениях 12139, 12143 и 12165 выявляются альтернативные сайты полиаденилирования, локализованные ниже AAUAAA поли-А сигнальной последовательности на 15, 19 и 41 нуклеотид.
Ген фактора VII содержит 5 областей тандемных повторов, образуемых олигонуклеотидными мономерами. Более четверти интронов и более трети 3'-нетранслируемой области сформированы данными минисателлитными тандемными повторами.
Смотрите также:
