Коагуляционный фактор XIII. Строение гена "а" cубъединицы фактора XIII
Первичная структура "а" субъединицы фактора XIII была установлена на основе комбинации клониравания кДНК и аминокислотного секвенса. Первоначально была выявлена первичная структура фрагмента, возникающего после активации фактора XIII трипсином, из 37 аминокислот ( Takagi T.,1974 ; Nakamura S.,1975 ) и активного центра ( Holbrook J.J.,1973 ).
В 1986 году была опубликована аминокислотная последовательность "а" субъединицы плацентарного фактора XIII ( Takahashi N.,1986 ), установленная на основе пептидного секвенса. В этом же году независимо друг от друга Grundmann U. ( Grundmann U.,1986 ) и Ichinose A. ( Ichinose A.,1986 ) проклонировали кДНК "а" субъединицы плацентарного фактора XIII. В работе Grundmann U. кДНК содержала 5'некодирующую последовательность из 84 нуклеотидов, кодирующую часть из 2196 нуклеотидов и 3'некодирующую область протяженностью из 1625 нуклеотидов. У Ichinose A. выделенный клон кДНК содержал 5'некодирующую область, область кодирующую 341 аминокислоту, 3'некодирующую область из 1535 нуклеотидов, в которой сайт полиаденилирования AATAAA предшествовал поли-А концу из 10 нуклеотидов на расстоянии 14 пар оснований. Нуклеотидная и аминокислотная последовательности гена субъединицы "а" фактора XIII представлены на рис. F 13a seq ( Рис. F 13a seq ).
В 1988 году Ichinose A. ( Ichinose A.,1988 ) проклонировал ген "а" субъединицы фактора XIII человека. По протяженности ген составляет более 160 килобаз. Ген состоит из 15 экзонов и 14 интронов (A-N). Первый интрон находится в 5'некодирующей области гена на расстоянии 18 нуклеотидов от инициирующего кодона. Семъ интронов (B,C,D,G,I,K,L) относятся к типу l, четыре интрона (S,F,J,M) - к типу 0, два интрона (H,N) - к типу ll. Экзон-интронные сочленения гена представлены в таблице F 13a int ( Таблица F 13a int ). Интроны разделяют ген на отдельные области-домены. Так, 37 аминокислотный фрагмент, возникающий при активации трипсином, целиком кодируется экзоном 2. Активный центр фактора XIII кодируется экзоном 7. Область, инактивируемая трипсином, кодируется экзоном 12. Два кальций-связывающих сайта кодируются соответственно экзонами 6 и 11.
5'область содержит регуляторные элементы транскрипции, обратный "CCAAT" бокс на расстоянии 210 нуклеотидов от +1 нуклеотида. Данная последовательность функционирует в любой ориентации. Три "TATA" подобные, "GTAAA", "TAGAA" и "TTTAA" последовательности локализуются в позициях 170, 150 и 40 перед +1 нуклеотидом соответственно. Несколько "GC" кластеров лежат в 5' фланкирующей области гена.
Хотя "а" субъединица представляет собой секретируемый в кровь пептид, в 5' конце не выявлено типичных гидрофобных лидерных последовательностей. Динуклеотид "TA" на расстоянии 14 нуклеотидов от "AATAAA" последовательности на 3'конце служит сигналом поиладенилирования.
Смотрите также:
