E2F-зависимые гены
Только немногие E2F-зависимые гены содержат выраженный ТАТА- бокс. К ним относятся протоонкогены семейства myc и гены гистонов . Промоторы генов машины клеточного типа, кодирующие ферменты и факторы репликации и репарации ДНК, а также ген B- myb, не содержат выраженного ТАТА- бокса .
В большинстве случаев E2F-сайты лежат в пределах 150 п.н. выше старта транскрипции, а в промоторах гена dhfr (дигидрофолатредуктазы) сайт E2F перекрывает старт транскрипции (сайты 20и 22). Есть примеры расположения этих сайтов в некодирующей части первого экзона ( сайты 11, 24,26) и в первом интроне (сайт 25).
E2F- зависимые гены часто имеют по два сайта связывания факторов E2F. Это рассмотренные ранее гены фактора E2F-1 человека и мыши ( Johnson D.G., Ohtani K., ea., 1994 , Neuman E., Flemington E.K., ea., 1994 , Hsiao K.-M., McMahon S.L., ea., 1994 , Li Y., Slansky J.E., ea., 1994 ), протоонкогены c-myc ( Hiebert S.W., Lipp M., ea., 1989 , Mudryi M., Hiebert S.W., ea., 1990 ) и N-myc ( Hiebert S.W., Blake M., ea., 1991 ), ген, кодирующий белок р107 ( Zhu L., Zhu L., ea., 1995 ), ген циклина Е ( Ohtani K., DeGregory J., ea., 1995 ).
Интересно, что во всех случаях сайты расположены на очень близком расстоянии: непосредственно друг за другом или на расстоянии 10-15 п.н. Два сайта E2F в гене p107 действуют кооперативно - их наличие обеспечивает синергичную активацию транскрипции ( Zhu L., Zhu L., ea., 1995 ). Мутации 5` -сайта приводят к сохранению 30% промоторной активности, в то время как мутации 3` - сайта снижают активность промотора до 9% от уровня активности, обеспечиваемого нативными сайтами ( Zhu L., Zhu L., ea., 1995 ).
Эти данные позволили считать, что два сайта связывания фактора E2F в гене p107 образуют композиционный элемент, который был занесен в базу данных COMPEL ( Кель О.В., Кель А.Э. ,ea., 1997 ). Доказательство функционального синергизма между двумя сайтами E2F, полученное на примере гена p107, и наличие парных сайтов в регуляторных областях других генов позволяют предположить, что и в других случаях сайты E2F могут действовать кооперативно.
Расположение E2F- сайтов относительно старта транскрипции их структура, контекст и нуклеотидное окружение в регуляторных районах различных генов значительно отличаются. По-видимому, такое разнообразие сайтов E2F обеспечивает множественность механизмов модуляции их связывания членами семейства E2F и, тем самым, многообразие механизмов регуляции транскрипции этих генов на разных стадиях клеточного цикла.
Смотрите также:
