ДНК участок GRE: Консенсусная последовательность


Консенсусная последовательность GRE, выведенная в результате сравнительного анализа их первичной структуры, представляет собой несовершенный инвертированный повтор GGTACAnnnTGTTCT [ Beato M. et al., 1989 ].

Составляющие повтор гексануклеотиды разделены спейсером из трех пар нуклеотидов. При этом правая часть повтора - гексануклеотид TGTTCT - гораздо более консервативна, чем левая [ Beato M. et al., 1989 , Seledsov I.A. et al., 1991 ].

Известные сайты связывания рецепторов таких стероидных гормонов , как прогестины , минералокортикоиды , андрогены , гомологичны консенсусной последовательности GRE, которая в искусственных конструкциях способна обеспечивать активацию транскрипции под действием этих гормонов [ Truss M. et al., 1993 ]. Показано, что GRE в длинном концевом повторе MMTV ответственны также и за индукцию генов этого провируса прогестероном , поэтому эти элементы часто называют HRE .

Способность указанной выше группы рецепторов стероидных гормонов узнавать одни и те же регуляторные элементы в ДНК определяется большим сходством их ДНК-связывающих доменов [ Mangelsford D.J. et al., 1995 ]. Механизмы, обеспечивающие специфичность действия глюкокортикоидов, прогестинов, минералокортикоидов и андрогенов, пока еще мало изучены.

Известно, что встроенные непосредственно перед гетерологичным промотором и репортерным геном фрагменты ДНК, соответствующие "классическому" консенсусу GRE, способны функционировать как GRE в искусственных конструкциях [ Strahle U. et al., 1988 , Slater E.P. et al., 1985 , Rhodes C. et al., 1995 ]. Остается неясным, могут ли такие одиночные GRE сами по себе обеспечивать индукцию природных генов глюкокортикоидами [ Lucas P.C. et al., 1992 ]. Так, например, показано, что GRE из энхансера гена ТАТ крысы , встроенный вблизи промотора на расстоянии 351 п.н. выше старта транскрипции этого гена, не может опосредовать гормональную индукцию. Чувствительность к гормонам в этом случае появлялась только после встраивания вблизи GRE дополнительных регуляторных элементов: второго GRE, сайтов связывания транскрипционных факторов NF-1 или SP1 , либо СААТ-бокса [ Strahle U. et al., 1988 ].

Смотрите также:

  • nGRE: Строение и функционирование
  • ДНК участок GRE необычного строения
  • ДНК участок GRE