Короткие ОРС как регуляторы трансляции
Около 10% мРНК растений содержат в своих 5'-концевых лидерных последовательностях более одного AUG-кодона . Некоторые из них удаляются с помощью альтернативного сплайсинга . Другие возникают в результате использования РНК-полимеразами альтернативных промоторов при инициации транскрипции соответствующих генов. Присутствие коротких ОРС в лидерных последовательностях мРНК, как правило, сопровождается снижением эффективности трансляции таких матриц. Функционирование этого механизма обнаружено в клетках млекопитающих, растений и дрожжей.
Влияние коротких ОРС на трансляцию расположенных ниже последовательностей нуклеотидов мРНК исследовано с использованием искусственных генно-инженерных конструкций, в которых изменяли длину и число потенциальных сайтов инициации трансляции, предшествовавших генам-репортерам. Оказалось, что ингибирующее действие коротких ОРС возрастает с увеличением их длины. Даже одиночный AUG-кодон снижает уровень трансляции ниже расположенных последовательностей в два раза. Короткие ОРС промежуточной длины (около 30 кодонов) обладали пятикратным ингибирующим действием, а протяженные ОРС (>100 кодонов) полностью подавляли трансляцию следующих за ними последовательностей. Механизм ингибирующего действия коротких ОРС связан с тем, что они транслируются, что снижает вероятность инициации трансляции на инициирующих кодонах, расположенных вслед за ними, поскольку процесс реинициации трансляции требует вхождения новых факторов инициации трансляции в инициаторный комплекс, включающий рибосому.
Смотрите также:
