Методы SSCP
Обнаружение мутаций путем оценки конформационного полиморфизма одноцепочечных фрагментов ДНК ( SSCP - single-stranded conformation polymorphism ).
Отдельные цепи денатурированных фрагментов ДНК образуют вторичную структуру, особенности которой зависят от последовательности нуклеотидов. Конформация одноцепочечных фрагментов ДНК, образовавшаяся во время их рефолдинга (сворачивания после тепловой денатурации и быстрого охлаждения, при котором большинство фрагментов остается в одноцепочечной форме), влияет на электрофоретическую подвижность фрагментов. Наличие в анализируемом фрагменте ДНК одной или нескольких мутаций приводит к формированию специфической вторичной структуры, которая будет отличаться от структуры фрагментов ДНК дикого типа, что обнаруживается по изменению электрофоретической подвижности фрагментов.
Метод оценки конформационного полиморфизма одноцепочечных фрагментов ДНК позволяет выявлять до 80% мутаций, но не дает возможности точно их локализовать.
Смотрите также:
