Микроматрицы ДНК: исследование генетического полиморфизма ДНК
Способность зондов гибридизоваться с ДНК микроматриц изменяется при наличии единственного неспаренного нуклеотида в гибридах зонд-мишень, что позволяет осуществлять поиск полиморфизмов в сравниваемых геномах на уровне различий в отдельных нуклеотидах. Например, путем гибридизации геномной ДНК двух штаммов дрожжей с микроматрицами олигонуклеотидов удалось картировать на участке ДНК длиной в 57 т.п.о. полиморфные локусы, детерминирующие множественную лекарственную устойчивость .
Детальное сравнение экзона 11 гена BRCA1 человека с гомологичными последовательностями семи других биологических видов позволило обнаружить отдельные полиморфные нуклеотиды с замечательной точностью (99,5-99,9%).
Такого рода результаты дали возможность разработки на основе микроматриц ДНК нескольких ДНК-диагностикумов, с помощью которых обнаруживают полиморфизмы на уровне отдельных нуклеотидов в геноме вирусов, бактерий, дрожжей и высших эукариот. Были идентифицированы мутации в геноме человека, ассоциированные с различными заболеваниями, включая рак молочной железы , муковисцидоз , бета-талассемию , диагностирована ВИЧ-инфекция . В исследовании участка генома человека длиной в 2,3*106 п.о. было обнаружено около 2000 полиморфизмов на уровне отдельных нуклеотидов, что позволяет представить себе масштабы генетической изменчивости в популяциях человека.
Смотрите также:
