SINE ДНК повторы (short interspersed elements)


Длина SINE-элементов составляет 90-400 п.о.

Хорошо изученными повторами класса SINE в геноме человека и некоторых приматов являются так называемые Alu-повторы . длина повторяющейся единицы которых составляет около 300 п.о. Alu- повторы представлены в геноме человека ~106 копиями и в среднем встречаются через каждые 4 т.п.о., составляя ~5% от суммарного количества ДНК. Аналогичные в структурном отношении повторы, названные B1, обнаружены в геноме мышей и под другими названиями описаны у многих млекопитающих.

 Также как и гены транспортных РНК эукариот, многие короткие повторы содержат внутренний расщепленный промотор РНК-полимеразы-III . Большинство SINE являются ретропоследовательностями (т.е. их новые копии возникают за счет обратной транскрипции с РНК-матрицы и последующей интеграции в геном). Наиболее известными повторами этого семейства являются Alu-повторы в геноме человека, B1 и B2 семейства в геноме грызунов.

Смотрите также:

  • Поиск и классификация альфа - сателлитных повторов
  • Повторы в эукариотическом геноме
  • Диспергированные повторы (SINE, LINE)
  • Функциональная значимость избыточной ДНК
  • FWA Ген
  • Ретротранспозиция (ретропозиция)
  • ДНК: умеренно повторяющиеся последовательности диспергированные (MER)