ДНК участок ARE-элементы (adenylate/uridylate-rich elements)


Время жизни эукариотических мРНК в цитоплазме контролируется их 3'-концевыми нетранслируемыми последовательностями (UTR). Лабильные мРНК содержат в этой области одну или несколько AU- богатых последовательностей длиной около 50 нуклеотидов, называемых ARE-элементами (adenylate/uridylate-rich elements), которые придают полирибонуклеотиду конформации, делающие его высокочувствительным к расщеплению нуклеазами. Искусственное введение таких последовательностей в 3'-концевые области стабильных мРНК приводит к их дестабилизации, что сопровождается резким уменьшением внутриклеточного времени полужизни гибридных мРНК.

ARE-элементы были впервые обнаружены у генов цитокинов , участвующих в воспалительных реакциях организма, и описаны для мРНК генов c-fos , c-myc , nur77 , junB , бета-интерферона , интерлейкина 3 , гранулоцит-макрофагового колонийстимулирующего фактора (GM-CSF) и других мРНК. Длина ARE-элементов варьирует от 50 до 150 нуклеотидов, они содержат несколько копий пентануклеотида AUUUA и много остатков U, перемежающихся остатками A.

Различают три класса ARE-элементов. Элементы 1-го класса (тип c-fos) содержат одну-три копии последовательности AUUUA, ассоциированные с U-богатой областью или гомополимером U. Для элементов 2-го класса (тип GM-CSF) характерно наличие двух копий перекрывающихся нонануклеотидных последовательностей UUAUUUA(U/A)(U/A), включенных в U-богатую последовательность. Элементы 3-го класса (тип c-jun) не содержат последовательности AUUUA.

Смотрите также:

  • мРНК: деградация: общие сведения
  • мРНК: ARE-зависимая деградация
  • мРНК ДЕГРАДАЦИЯ