Микоплазмы: систематика на основе анализа белков
С целью реконструкции филогенетических отношений в бактериальной геносистематике в качестве маркерных молекул разные авторы использовали RecA ( Eisen, 1995 ), EF-TU ( Delwiche et al., 1995 ), БТШ и GroEL ( Viale et al., 1994 ), DnaJ ( Bustard, Gupta, 1997 ), DnaK ( Boorstein et al., 1994 ; Gupta et al., 1994 ; Rensing, Maier, 1994 ). При реконструкции филогенетических отношений более целесообразно использование аминокислотных последовательностей белков, чем нуклеотидных последовательностей генов, поскольку именно на белковом уровне закладываются основы фенотипических изменений.
Нуклеотидные последовательности остаются незаменимыми для оценки временных интервалов по методу "молекулярных часов" .
Результаты DnaK-реконструкции оказываются ближе филогенетическому построению, в соответствии с которым предполагают полифилетическое происхождение микоплазм, а к классу Mollicutes относят некоторых представителей Lactobacillus, Streptococcus, Clostridia и Erysipelothrix ( рис. 23 ), несмотря на то, что эти бактерии обладают клеточной стенкой. Однако они могут образовывать и бесстеночные L-формы. Это подтверждает представления о возможном происхождении микоплазм от L-форм бактерии или о наличии у них общих предковых форм ( Тимаков, Каган, 1973 ).
Подобную точку зрения высказывал Сладек ( Sladek, 1986 ), он рассматривал L-форму как начальную и основную ступень в дальнейшей эволюции микоплазм. Отсутствие клеточной стенки могло благоприятствовать неоднократному слиянию L-форм бактерий разных видов, образованию гибридных клеток, содержащих несколько геномов, и соответственно генетическим рекомбинациям, образованию повторяющихся последовательностей ДНК, делециям, а также другим реорганизациям генома по типу "выщепления-встраивания". Однако только ли бактериальные геномы явились источником формирования геномов микоплазм? Известно, что многие микроорганизмы обладают способностью осуществлять с достаточно высокой частотой горизонтальный перенос генов (ГПГ) ( Kehoe et al., 1996 ; Baumler, 1997 ; Barbero, Fani, 1998 ).
Смотрите также:
