Негомологичные рекомбинации у эукариот


В работе Конопки ( Konopka, 1988 ) сделана попытка классификации различных районов негомологичных рекомбинаций эукариот с точки зрения особенностей контекста в этих районах. Проанализировано 496 таких районов, каждый из которых включал 8 нуклеотидов, окружающих точку рекомбинации. Исследовалось наличие в этих районах тринуклеотидов VAT и STY, которые связаны с топоизомеразной активностью , потенциальной z-ДНК , полипуриновых и полипиримидиновых трактов , наличие A и T оснований. Анализ с использованием статистических критериев показал, что во многих случаях в сайтах рекомбинаций присутствовали тринуклеотиды, опознаваемые топоизомеразой I . В то же время, случайное расположение тринуклеотидов относительно точки рекомбинации не подтверждает прямое участие топоизомеразы в образование разрывов ДНК в точках рекомбинации. Показана неслучайная связь позиций мутаций с политрактами и участками чередования пуринов и пиримидинов. На основе полученных данных автор предполагает наличие целого ряда альтернативных путей возникновения рекомбинаций, опосредуемые через различные факторы контекста (Konopka, 1988).

Ряд работ указывает на неслучайность связи точек рекомбинаций в эукариотических геномах с короткими прямыми повторами ( Hasson et al., 1984 ; Ogihara et al., 1988 ).