MSUD.Строение гена E1 бета BCKDH комплекса
Ген E1 бета субъединицы дегидрогеназы кетокислот с разветвленной цепью
В 1990 году была выделена кДНК E1 бета субъединицы дегид- рогеназы кетокислот с разветвленной цепью (BCKDH) быка ( Nobukuni Y.,1990a ). Выделенная кДНК содержала 5' нетранслируе- мую последовательность из 186 нуклеотидов, транслируемую последо- вательность из 1176 нуклеотидов и 3' нетранслируемую последова- тельность из 306 нуклеотидов с поли-А концом. Из нуклеотидной по- следовательности кДНК была выведена аминокислотная последователь- ность для 342 аминокислотных остатков.
В том же году были опубликованы две работы по клонированию и секвенированию кДНК Е1 бета субъединицы комплекса BCKDH челове- ка ( Chuang J.L.,1990 ; Nobukuni Y.,1990b ). Транслируемая последо- вательность кДНК (1176 bp) кодирует лидерную последовательность предшественника зрелого пептида из 50 аминокислот, отщепляемых при транспортировке через мембрану митохондрий, и собственно аминокис- лотную последовательность из 342 аминокислотных остатков бета субъ- единицы. На Рис. 20 представлена нуклеотидная (мРНК) и аминокислот- ная последовательности бета субъединицы дегидрогеназы.
В 1991 году был клонирован ген Е1 бета субъединицы дегид- рогеназы человека ( Mitsubuchi H.,1991a ). Данный ген протяженнос- тью около 100 килобаз состоит из 10 экзонов. Размер экзонов колеб- лется от 69 до 298 пар нуклеотидов, величина интронов варьирует от 0,8 до 25 килобаз. В таблице 26 ( Таблица 26 ) приведены экзон-инт- ронные сочленения гена Е1 бета субъединицы дегидрогеназы. Кодирующая часть гена составляет 1,4% нуклеотидной последовательности гена.
В 5'области данного гена выявлены последовательности CCAAT, представляющие канонические CAAT бокс ы и комплементирующая после- довательность ATTGG в позиции нуклеотидов -39 и -75. В гене отсут- сутствуют канонические TATA боксы. Кэп сайт локализуется в положе- нии - 47.
Присутствуют три мотива связывания транскрипционных факто- ров SP1 (CCGCCC), инвертированная форма (GGGCGG) в позициях от -98 до -93, от -56 до -51 и от -13 до -8. Два мотива энхансерных после- довательностей (TGGAAA) расположены в положениях нуклеотидов от -532 до -527 и от -311 до -2306. Промоторная область гена содержит прямые (DR) и инвертированные (IR) повторы. На Рис. 20a представле- на 5'фланкирующая область гена.
В 3' нетранслируемой области гена из 160 нуклеотидов рас- положен сигнал полиаденилирования AATAAT , лежащий ниже поли-A кон- ца на 13 нуклеотидных оснований.
Смотрите также:
