ген E2 BCKDH комплекса (заболевание MSUD)
Gene: [01p31/BCKDE2] dihydrolipoamide branched chain transacylase (E2 component of BCKD)
Ген Е2 компонента BCKDH комплекса
В 1988 и 1989 годах была опубликована нуклеотидная последовательность кДНК ацилтрансферазы человека (E2 компонента BCKDH комплекса ) ( Hummel K.B.,1988 ; Danner D.J.,1989 ; Lau K.S.,1988 ; Nobukuni Y.,1989 ). Открытая рамка считывания кДНК (1431 bp) кодирует пептид из 477 аминокислотных остатков. Данный пептид включает в свой состав лидерную последовательность из 56 аминокислот, отщепляемых при прохождении через мембрану митохондрий, и зрелый пептид из 421 аминокислоты, включающий в свой состав домен связывания с Е3 компонентом, домен связывания с липоилом, и домен "inner core".
В 1992 году был проклонирован ген Е2 компонента BCKDH комплекса человека ( Lau K.S.,1992 ). Данный ген, протяженностью 68 килобаз, состоит из 11 экзонов. Размер экзонов колеблется от 62 до 2239 пар оснований, размер интронов варьирует от 1,0 до 12,5 килобаз. В Таблице 27 представлено экзон-интронные строение гена.
Экзонная часть гена кодирует препептид из 482 аминокисотных остатков. Сайт трансляции (met кодон) выявлен в позиции -61, в ранее опубликованных работах данный сайт локализовали в положении -56. Лидерная последовательность препептида из 61 аминокислотного остатка, впоследствии отщепляемая, кодируется 1 - 3 экзонами. Зрелый пептид, включащий в свой состав 421 аминокислоту, кодируется 3 - 11 экзонами. Одинадцатый экзон содержит три Alu повтора. На Рис. 21 представлена нуклеотидная (мРНК) и аминокислотная последовательности гена.
5' фланкирующаая область гена не содержит канонических TATA боксов. CCAAT последовательность локализована в позиции от -537 до -541. В данной области гена расположены два SP1 мотива (GGGCGG) в позициях от -401 до -406 и от -132 до -137 (CCGCCC); пять GRE элементов (TGTTCT) в позициях от -566 до -571, от -421 до -426, от -414 до -419, от -368 до -373, от -2 до -7; два CRE элемента в позициях от -136 до -143 и от +1 до -7; AP-2 элемент (CCCCAGGC) в позиции от -185 до -192; три FSE-1 элемент а в пози- циях от -565 до -576, от -204 до -215, и от -176 до -187; FSE-2 элемент в позициях от - 506 до -518; а также прямые [DR] (-626/ /-633; -243/-250; -607/-614; -261/-268; -414/-423; -283/-291; -408/-416; -238/-246) и инвертированные [IR] (-253/-265; -20/-32) повторы. На Рис. 21a представлена 5'фланкирующая область гена.
Смотрите также:
