Таб. 01 spl Консенсус сайтов сплайсинга
Консенсус последовательностей 5' сайтов сплайсинга позвоночных (донорные)
********************************************************************************
э к з о н * и н т р о н
********************************************************************************
%G 23 14 13 77* 100 0 32 12 84 18 30 22
%A 34 35 62 8* 0 0 60 74 9 15 33 22
%U 15 12 13 8* 0 100 5 7 3 50 17 25
%C 29 38 12 8* 0 0 3 7 4 17 21
31
- - A G* G U A A G U - - ******************************************************************************** Консенсус последовательностей 3' сайтов сплайсинга позвоночных (акцепторные)
********************************************************************************
и н т р о н * э к з о н
********************************************************************************
%G 15 10 10 7 7 10 9 5 5 5 24 0 0 100* 55 27 24
%A 8 9 7 4 9 8 10 8 4 9 26 2 100 0* 20 21 19
%U 46 46 56 59 43 49 41 46 42 46 23 19 0 0* 8 32 28
%C 32 35 27 30 42 33 40 40 49 41 27 78 0 0* 17 20
28
Py Py Py Py Py Py Py Py Py Py N C A G* G - - ******************************************************************************** Таблица получена в результате выравнивания около 1000 последовательностей позвоночных из GenBank R.55
Отлично видно правило GU--AG
Смотрите также:
