Таб.01 spl Элайнмент структур U4 мяРНК
Stem II 5'Stem/Loop Stem I
************************************************************************
* 10 20 30 40 50
60 *
*.AUCCUUAUGCAC.GGGAAA U ACGCAUAUC AGUGAGGAUUCGUCCGA GAUUGUGU UUU
UGCUGG*S.c.
*.AUCCUUAUGCAC.GGGAAA U ACGCAUAUC AGUGAGGAUUCGUCCGA GAUUGUGU UAU
UGCUGG*K.l.
*AAUGCUUGCGCA..GGGAGG U GUGAA.CGC AA.GAUCCUCAGG.UGA UUGUUCAC UAG
UGC.AA*Trip
*.AUCUUUGUGCUUGGGGCAA U GACGUAGCU AGUGAGGAUUCGAACGA GGCGCGUC UAU
UGCUGG*Bean a
*.AUCCUUAUGCAC.GGGAAA U ACGCAUAUC AGUGAGGAUUCGUCCGA GAUUGUGU UAU
UGCUGG*Bean b
*.AGCUUUGCGCUC.GGGAAA U AACGUGACC AAUGAGG.CUUUGCCGA GGUGCGUC UAU
UGCUGG*Worm
*
*
*.A.CYUuRYGC....GG.RR U R.....ryY ARuGArg.YY...cYGA gry....Y Uau
UGCuRR*Cons
************************************************************************
5 ' Концевой домен
Приведены выравненные последовательности
S.c. (Saccharomyces cerevisiae),
Bean (Vicia faba),
Trip (Trypanasoma brucei),
K.l. (Kluyveromyces lactis),
Worm (Caenorhabditis elegans).
РНК произвольно разделена на три домена.
Стебли I и II относятся к внутримолекулярным спиралям формируемым с U6.
Sm относится к консенсусу сайта связывания белка Sм. (
СМ. ДАЛЕЕ
) Данные взяты из
Guthrie C., Patterson B. 1988
Смотрите также:
