Таб.02 spl Элайнмент структур U4 мяРНК
Central Stem /Loop ************************************************************************ * 70 80 90 100 110 120 * *GAAAUUUAAUUAUAAACCA.GACCGUC UCCUCAUGGUCAAUUCGGUGUUCG CUUU...... UGAAUA*S.c. *GAAAUUU.AUUUUUAACCAUGACCUCC UCCUCAUAACGUAUUGUGU..... CUUUCAUUUU .....A*K.l. *........ACUAUAU.CCGGUAC.... UCC..................... .UUCGG.... ......*Trip *GAAA....ACUAUUUGCCAA.ACC..C CUCUUAGGCUUGGG.......... CUUGGG.... ......*Bean a *GAAA....ACUAUUU.CUAA.ACCC.C CUCUUAGGCUUGAG.......... .UUUAA.... ......*Bean b *GAAA....ACUUUUC.CCAAUUGCC.C CUCUUAGGCUUGAG.......... .UGAAACAU. ......*Worm * * *gaaa....AYU.U...Cca..acc..C .Yc.yr.................. .U...r...........* ************************************************************************ Центральный домен Приведены выравненные последовательности S.c. (Saccharomyces cerevisiae), Bean (Vicia faba), Trip (Trypanasoma brucei), K.l. (Kluyveromyces lactis), Worm (Caenorhabditis elegans). РНК произвольно разделена на три домена. Стебли I и II относятся к внутримолекулярным спиралям формируемым с U6. Sm относится к консенсусу сайта связывания белка Sм. (СМ. ДАЛЕЕ) Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988Смотрите также:
